清華大學的戴俊彪團隊,則設(shè)計合成了12號染色體。在研究中,他們開發(fā)了長染色體分級組裝的策略,即:首先通過大片段合成序列,在6個菌株中分別完成了對染色體不同區(qū)域內(nèi)源DNA的逐步替換;然后利用酵母減數(shù)分裂過程中同源重組的特性,將多個菌株中的合成序列進行合并,獲得完整的合成型染色體。針對12號染色體上存在的高度重復的核糖體RNA編碼基因簇進行刪除及工程化改造,并利用修改后的重復單元在基因組多個位點重建了核糖體RNA編碼基因簇?!霸摴ぷ鞯於宋磥韺ζ渌?、結(jié)構(gòu)超復雜的基因組進行設(shè)計與編寫的基礎(chǔ),同時也證明了酵母基因組中rDNA(核糖體DNA)區(qū)域及其他序列均具有驚人的靈活度與可塑性。”戴俊彪表示。
深圳華大基因研究院與英國愛丁堡大學共同完成2號染色體的從頭設(shè)計與全合成(長770 Kb),合成酵母菌株展現(xiàn)出與野生型高度相似的生命活性。該論文的第一作者、深圳國家基因庫合成與編輯平臺負責人沈玥介紹說,科研人員使用“貫穿組學(Trans-Omics)”方法,從表型、基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和代謝組五個層次系統(tǒng)地進行基因型-表現(xiàn)型的深度關(guān)聯(lián)分析,證明了人工設(shè)計合成的釀酒酵母基因組可增加、可刪減的高度靈活性?!?/p>
令人欣喜的是,華大基因與愛丁堡大學合成的酵母菌株,不僅與野生型有高度相似的生命活性,而且對環(huán)境的適應(yīng)性大大加強,其進化速度呈幾何級提高。
人工合成4條酵母染色體,價值幾何?
“2000年公布的人類基因組測序,中國只承擔了百分之一的工作,這次我們完成了釀酒酵母染色體合成的四分之一,可以說是中國在合成生物學領(lǐng)域取得的突破性成果,進一步奠定了我國在這一領(lǐng)域的國際地位。”楊煥明說,“兩相比較,不難看出我們在生命科學研究領(lǐng)域的巨大進步。在釀酒酵母設(shè)計與合成研究中,我們已由‘跟跑’轉(zhuǎn)為‘并跑’,今后‘領(lǐng)跑’也不是不可能?!?/p>