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治療腦型瘧疾目前首選的是青蒿素類藥物，在臨床上使用較多的如青蒿琥酯、蒿甲醚，采用靜脈注射，或者是肌肉注射的方式，可以快速有效的降低，在人體運輸中的載量，從而能夠快速挽救腦型瘧疾的患者。目前采用這種方式，死亡率依然較高，在部分地區(qū)死亡率超過了50%。因此，對于腦型瘧疾的患者，早期全程足量使用抗菌藥，是治療腦型瘧疾的重要要求。同時還要使用腦細胞的保護藥物，或者是降低顱內(nèi)壓，加快腦細胞代謝的藥物，這些綜合抗瘧保護治療的措施，可以及時挽救腦型瘧疾的患者，從而使得患者能夠快速恢復。腦型瘧疾是瘧疾最重要的表現(xiàn)形式，大多數(shù)患者都會出現(xiàn)中樞神經(jīng)系統(tǒng)功能障礙，如昏睡、昏迷、抽搐、肢體活動障礙、惡心、嘔吐、腦疝等。