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多器官功能障礙綜合征的發(fā)病機(jī)制主要為炎癥介質(zhì)、腸道細(xì)菌移位和缺血再灌注損傷。若機(jī)體感染、外傷、心跳呼吸驟停、大手術(shù)的情況下，可形成自我保護(hù)，產(chǎn)生炎癥介質(zhì)，過量時(shí)可誘發(fā)身體其他部位損傷。一般正常人腸道里部分細(xì)菌有益于機(jī)體健康，但若為腸道粘膜缺血時(shí)，細(xì)菌可能會(huì)轉(zhuǎn)移到其他部位，引起全身的損傷。另外，若心肌缺血后人為安放支架，使心肌再灌注，其產(chǎn)生的氧自由基亦會(huì)引起多器官功能障礙綜合征。