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克羅恩病的確診非常復雜，需要通過臨床表現(xiàn)、組織病理學檢查、手術的病理檢查以及長時間的隨訪等，才能得以確診。其臨床表現(xiàn)為腹痛、腸梗阻、腹部包塊、瘺管、肛瘺、體重減輕、營養(yǎng)不良，以及腸外表現(xiàn)如皮損、關節(jié)炎等。在我國，腸結核發(fā)病率很高，和克羅恩病的臨床表現(xiàn)、組織學表現(xiàn)、臨床過程、手術等大體有非常相似之處，兩者的鑒別診斷一直困擾著醫(yī)生。所以克羅恩病的確診往往需要很長時間，一旦確診，屬于終身性疾病。其治療和腸結核有相違、相對立之處，應謹慎對待，部分患者手術后數(shù)年仍無法確診。