鮮黃花菜本身沒有毒，但其中含有一種名為秋水仙堿的物質，這種物質在經過體內氧化之后會變?yōu)槎锼蓧A，對身體有比較大的毒性。如果直接食用，可能會出現惡心嘔吐、腹痛腹瀉的中毒反應。
如果想要吃新鮮的黃花菜，可以用熱水焯一下或者使用鹽水進行浸泡，這樣可以使秋水仙堿的毒性減弱或消失。處理過后的黃花菜中，含有豐富的卵磷脂，是人體大腦的重要組成部分，適量食用可以促進大腦發(fā)育或延緩大腦細胞衰老，改善視覺功能。黃花菜中還含有大量維生素A和胡蘿卜素、膳食纖維，可以穩(wěn)定血壓，促進腸胃蠕動，潤腸通便，預防便秘。但黃花菜性涼、味甘，大量食用會導致脾胃虛寒，所以應適量食用。部分人群對黃花菜中的植物花蕾、花粉等過敏，應避免食用，防止誘發(fā)不良狀況。
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