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當智齒發(fā)生阻生后，它的頜面及遠中軟組織不能退縮或者是退縮較遲，在牙冠表面形成齦瓣，由于齦瓣較厚，質地較硬，反過來可以阻礙牙齒的萌出，因而加重了牙齒的阻生。牙冠可能部分或全部為齦組織覆蓋，在齦瓣與牙冠之間形成較深的盲袋，食物碎屑極易嵌塞于盲袋內，為細菌繁殖提供了良好的生態(tài)環(huán)境。當冠部的牙齦因為受損形成潰瘍時，或者全身抵抗力低下時，局部存在的正常菌群失調，從而引起冠周炎的急性發(fā)作。關于冠周炎的細菌學經過多年研究，沒有發(fā)現有特殊的病原菌，它與一般口腔的感染相同，為口腔常見菌群的混合感染。近年來，隨著厭氧菌培養(yǎng)技術的改進，厭氧菌在冠周炎發(fā)病中的作用已經引起了廣泛的關注。