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引起肺炎的原因較多，包括病原微生物、免疫損傷、理化損傷、過敏及藥物因素等，肺炎以細菌性肺炎為主。能夠引起肺炎的病原微生物包括能夠引起細菌性肺炎的鏈球菌、金黃色葡萄球菌、克雷伯菌等；引起支原體非典型肺炎的支原體、軍團菌等；引起病毒性肺炎的冠狀病毒、腺病毒、流感病毒等；引起真菌性肺炎的白色念珠菌、曲霉菌、隱球菌；其他，如寄生蟲等病原微生物。