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小腸鏡檢查分為2次進(jìn)行，首先從口側(cè)進(jìn)入，如同胃鏡一樣，先到十二指腸，之后逐步向空腸進(jìn)鏡檢查，進(jìn)鏡時盡量向深處觀察，同時根據(jù)情況進(jìn)行活檢等。之后到達(dá)鏡子不能前進(jìn)的位置，會使用組織夾進(jìn)行標(biāo)記。其次再從肛門進(jìn)鏡，可以做完口側(cè)的同時進(jìn)行，也可以分時間進(jìn)行，根據(jù)病人的耐受程度進(jìn)行。從肛側(cè)進(jìn)鏡，先觀察結(jié)腸，再從小腸進(jìn)鏡，盡量找到組織夾所在位置，則可以將所有小腸全部觀察完整。小腸鏡檢查需要清腸處理，并且操作時間較長，痛苦也較大。因此目前有些檢查是膠囊內(nèi)鏡檢查，膠囊內(nèi)鏡是大拇指粗細(xì)的膠囊，含有攝像頭、電源，具有拍照裝置，會將照片傳到體外，在接收照片以后進(jìn)行評判分析，但是膠囊內(nèi)鏡不能取活檢。小腸鏡的操作主要是用于不明原因的出血，排除胃和結(jié)腸，明確小腸病變時需要先進(jìn)行小腸鏡檢查。