菌群移植治療對自閉癥的治療有一定效果，但目前仍處于試驗研究階段，尚未大規(guī)模應用于臨床。
菌群移植治療主要是通過將健康的菌群移植到患者體內(nèi)，從而重建自閉癥患者的腸道內(nèi)菌群平衡，達到治療疾病的目的。研究發(fā)現(xiàn)，腸道菌群與自閉癥的發(fā)生是直接或者間接相關的。一組病例報告研究了18名由ADI-R診斷為ASD患者，伴有中度至重度腸道問題的兒童（7-16歲），在進行為期8周的菌群移植FMT治療后，胃腸道癥狀平均減少約80%，便秘、腹瀉、消化不良及ASD癥狀顯著改善，且治療8周后相關癥狀仍然持續(xù)改善。
但是，雖然菌群移植治療宣稱安全、無害，但目前尚未報告菌群移植治療的副作用及安全性，缺乏相應的循證證據(jù)和理論支持。因此，對于自閉癥的治療，還需要更多的臨床研究和證據(jù)來支持菌群移植治療的有效性和安全性。
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