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非結(jié)核分枝桿菌的檢查方法主要是依靠實(shí)驗(yàn)室檢查，檢查技術(shù)包括涂片檢查，分離培養(yǎng)后進(jìn)行鑒定及藥敏試驗(yàn)、分子診斷技術(shù)等。 標(biāo)本來自肺內(nèi)和肺外，如痰液、支氣管沖洗液、支氣管肺泡灌洗液，肺、淋巴結(jié)、肝臟、腎臟和脾臟活檢組織，血液、骨髓分泌物，體液和糞便等標(biāo)本均可進(jìn)行非結(jié)核分枝桿菌的檢測(cè)。但不同臨床標(biāo)本所分離培養(yǎng)到的菌株臨床意義有所不同，來自血液、淋巴結(jié)、骨髓、肝臟、腎臟和脾臟等的標(biāo)本分離到的菌株往往意味著致病菌。而痰液、誘導(dǎo)痰、支氣管沖洗液等呼吸道標(biāo)本分離的菌株要排除標(biāo)本污染或呼吸道定植的可能，因此需要留取多份標(biāo)本。不同標(biāo)本不能在同一天采集，不應(yīng)使用口咽拭子培養(yǎng)或血清學(xué)檢測(cè)結(jié)果來診斷非結(jié)核分枝桿菌病。 如果考慮是非結(jié)核分枝桿菌病，在留取標(biāo)本期間要避免服用抗菌藥物，尤其是大環(huán)內(nèi)酯類、喹諾酮類、氨基糖甙類、磺胺類等藥物，如果患者正在使用這些藥物，建議必要時(shí)要停藥至少2周再去采集標(biāo)本。