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巴雷特食管不經(jīng)過藥物治療無法自愈。形成巴雷特食管的原因可能合并反流性食管炎，時間較長將導(dǎo)致食管鱗狀上皮被柱狀上皮替代。有時內(nèi)鏡醫(yī)生會在內(nèi)鏡下描述，食管可以見到胃黏膜異位顯像，其實為巴雷特食管在內(nèi)鏡下的表現(xiàn)，通過NBI胃鏡可以看到團塊狀、倒?fàn)?、蛇狀的胃黏膜異位顯像。此類病變治療，一方面要積極治療引起巴雷特食管的原因，即抗反流治療。若反流性食管炎的癥狀不能夠得到有效控制，巴雷特食管發(fā)生的數(shù)量、程度將逐漸加深。另一方面，內(nèi)鏡下懷疑有異型增生的巴雷特食管，可以進行內(nèi)鏡下的黏膜切除。部分病變還可以在內(nèi)鏡上用氬氣或高頻電進行燒灼、損傷，食管黏膜修復(fù)后，可以恢復(fù)到正常狀態(tài)。