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巧克力囊腫的原因到目前為止還沒有完全明確，主要原因涉及到機體免疫功能、遺傳、環(huán)境等因素。主要學說包括以下幾種： 1、經(jīng)血逆流種植學說：月經(jīng)血會經(jīng)過輸卵管逆流到盆腔里，經(jīng)血里有一些細胞在盆腔里扎根、發(fā)芽、生長，形成了子宮內(nèi)膜異位癥，經(jīng)血逆流是比較主流的學說； 2、體腔上皮化生學說：化生是一種醫(yī)學術語，即正常細胞向另一種細胞轉(zhuǎn)化。體腔上皮是由于間皮組成，但是這種間皮如果向上皮發(fā)展會形成子宮內(nèi)膜異位癥； 3、免疫缺陷：會導致經(jīng)血中的細胞適合于種植，也是原因之一； 4、對于遠處盆腔以外部位的子宮內(nèi)膜異位癥，是一種淋巴或者血行轉(zhuǎn)移學說。子宮內(nèi)膜細胞經(jīng)過經(jīng)血或經(jīng)過血液、淋巴液轉(zhuǎn)移到盆腔以外部位，生根、生長形成腹腔遠處內(nèi)膜異位癥，發(fā)生轉(zhuǎn)移。 有一些因素會促進內(nèi)膜異位癥發(fā)生和發(fā)展，月經(jīng)持續(xù)時間長的婦女，容易患內(nèi)膜異位癥，比如初潮早、絕經(jīng)晚，體內(nèi)長期雌激素刺激，此類女性容易患子宮內(nèi)膜異位癥。正常情況下月經(jīng)經(jīng)陰道排出，如果陰道局部或者生殖道有梗阻的病人，經(jīng)血不能夠通過陰道流出而逆流到盆腔和腹腔，這些病人也容易患子宮內(nèi)膜異位癥。有一些免疫系統(tǒng)的疾病，不能有效清除盆腔和腹腔逆流經(jīng)血，病人也容易患子宮內(nèi)膜異位癥。巧克力囊腫是子宮內(nèi)膜異位癥最重要的一種表現(xiàn)形式，也是臨床醫(yī)生處理最多的子宮內(nèi)膜異位癥的類型。