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心源性腦栓塞的輔助檢查主要在于查明是否存在心臟疾病，查明栓子來源，可以做24小時動態(tài)心電圖，注意患者有無心律失常、心房纖顫，尤其是陣發(fā)性的房顫，用普通的心電圖不容易檢測到，做24小時動態(tài)心電圖監(jiān)測，就增加了查出陣發(fā)性房顫的概率；還需要檢查經(jīng)食道心臟彩超，發(fā)現(xiàn)卵圓孔未閉、房間隔缺損、室間隔缺損、心臟瓣膜病等心臟的結(jié)構(gòu)異常；經(jīng)顱多普勒血流圖（TCD）、發(fā)泡試驗可以幫助證實有沒有心臟疾病導(dǎo)致的反常栓塞；如果懷疑感染性心內(nèi)膜炎引起的腦栓塞，化驗血常規(guī)、血沉需要反復(fù)多次進行血細菌的培養(yǎng)。顱腦磁共振、血常規(guī)、凝血功能這些檢查在心源性腦栓塞的治療期間，根據(jù)病情需要多次進行。