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對于胃底間質瘤來說，手術切除是唯一能夠達到治愈的方法。所以對于胃底部的間質瘤來說，應當首先對患者進行全身徹底檢查，明確是否有其余部位的轉移，而如果患者腫瘤只局限于胃底部，沒有其他部位轉移，那手術是最好的治療方式。但是不是所有患者在初次就診時就能夠施行手術切除，還需要看腫瘤大小，以及是否侵犯鄰近器官。如果瘤體比較巨大，或者侵犯鄰近器官，比如侵犯脾臟或侵犯膈肌，這樣手術很難達到根治性效果，所以在間質瘤手術之前，服用一段時間靶向治療藥物，將瘤體縮小，達到腫瘤降期的目的，之后再通過手術治療，才可以達到比較好的治療效果。所以對于胃間質瘤患者來說，一定要根據(jù)腫瘤大小，以及侵犯器官來決定綜合治療方式，并不是說所有患者初次就診時一定要立即進行手術治療。