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結核病的治療療程視病情而定，如患者肺部病灶比較少，病情比較輕，沒有明顯呼吸道癥狀和結核中毒癥狀，為初治的不耐藥患者，療程一般是六個月，前兩個月是強化治療，后四個月為鞏固治療。 假如患者為復治，而且肺部病灶比較廣泛，療程為9-12個月，前三個月為強化期，后6-9個月為鞏固期。若為耐藥患者，療程更長，一般是18-24個月。 對于合并糖尿病、真菌感染、肺外結核的患者，如腸結核、淋巴結核、腹腔結核或乳腺結核、骨結核等，療程最少要一年到一年半。